prokka_result - 3 region(s) - antiSMASH results

Identified secondary metabolite regions using strictness 'relaxed'

gnlProkkaIEKEONOM_17 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_17)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 16.1	cyclic-lactone-autoinducer	2,535	22,216

gnlProkkaIEKEONOM_44 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_44)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 39.1	T3PKS	79,775	120,944

gnlProkkaIEKEONOM_75 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_75)

Region	Type	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 67.1	terpene	1	19,453

Region	Type	From	To	Similarity
Region 16.1	cyclic-lactone-autoinducer	2,535	22,216
Region 39.1	T3PKS	79,775	120,944
Region 67.1	terpene	1	19,453

No secondary metabolite regions were found in these records:: gnlProkkaIEKEONOM_1 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_1); gnlProkkaIEKEONOM_2 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_2); gnlProkkaIEKEONOM_3 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_3); gnlProkkaIEKEONOM_4 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_4); gnlProkkaIEKEONOM_5 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_5); gnlProkkaIEKEONOM_6 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_6); gnlProkkaIEKEONOM_8 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_8); gnlProkkaIEKEONOM_9 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_9); gnlProkkaIEKEONOM_10 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_10); gnlProkkaIEKEONOM_11 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_11); gnlProkkaIEKEONOM_12 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_12); gnlProkkaIEKEONOM_13 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_13); gnlProkkaIEKEONOM_14 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_14); gnlProkkaIEKEONOM_15 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_15); gnlProkkaIEKEONOM_16 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_16); gnlProkkaIEKEONOM_19 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_19); gnlProkkaIEKEONOM_20 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_20); gnlProkkaIEKEONOM_22 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_22); gnlProkkaIEKEONOM_23 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_23); gnlProkkaIEKEONOM_24 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_24); gnlProkkaIEKEONOM_25 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_25); gnlProkkaIEKEONOM_26 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_26); gnlProkkaIEKEONOM_27 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_27); gnlProkkaIEKEONOM_28 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_28); gnlProkkaIEKEONOM_29 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_29); gnlProkkaIEKEONOM_30 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_30); gnlProkkaIEKEONOM_31 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_31); gnlProkkaIEKEONOM_32 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_32); gnlProkkaIEKEONOM_33 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_33); gnlProkkaIEKEONOM_34 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_34); gnlProkkaIEKEONOM_35 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_35); gnlProkkaIEKEONOM_36 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_36); gnlProkkaIEKEONOM_37 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_37); gnlProkkaIEKEONOM_38 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_38); gnlProkkaIEKEONOM_40 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_40); gnlProkkaIEKEONOM_42 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_42); gnlProkkaIEKEONOM_43 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_43); gnlProkkaIEKEONOM_45 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_45); gnlProkkaIEKEONOM_46 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_46); gnlProkkaIEKEONOM_47 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_47); gnlProkkaIEKEONOM_48 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_48); gnlProkkaIEKEONOM_49 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_49); gnlProkkaIEKEONOM_50 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_50); gnlProkkaIEKEONOM_51 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_51); gnlProkkaIEKEONOM_52 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_52); gnlProkkaIEKEONOM_55 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_55); gnlProkkaIEKEONOM_56 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_56); gnlProkkaIEKEONOM_57 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_57); gnlProkkaIEKEONOM_58 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_58); gnlProkkaIEKEONOM_59 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_59); gnlProkkaIEKEONOM_60 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_60); gnlProkkaIEKEONOM_61 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_61); gnlProkkaIEKEONOM_63 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_63); gnlProkkaIEKEONOM_64 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_64); gnlProkkaIEKEONOM_65 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_65); gnlProkkaIEKEONOM_66 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_66); gnlProkkaIEKEONOM_67 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_67); gnlProkkaIEKEONOM_68 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_68); gnlProkkaIEKEONOM_69 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_69); gnlProkkaIEKEONOM_70 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_70); gnlProkkaIEKEONOM_71 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_71); gnlProkkaIEKEONOM_72 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_72); gnlProkkaIEKEONOM_73 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_73); gnlProkkaIEKEONOM_74 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_74); gnlProkkaIEKEONOM_77 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_77); gnlProkkaIEKEONOM_78 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_78); gnlProkkaIEKEONOM_79 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_79); gnlProkkaIEKEONOM_80 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_80); gnlProkkaIEKEONOM_82 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_82); gnlProkkaIEKEONOM_83 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_83); gnlProkkaIEKEONOM_84 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_84); gnlProkkaIEKEONOM_85 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_85); gnlProkkaIEKEONOM_86 (original name was: gnl|Prokka|IEKEONOM_86)

Compact view

gnlProkkaIEKEONOM_17 - Region 1 - cyclic-lactone-autoinducer

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 2,535 - 22,216 nt. (total: 19,682 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

cyclic-lactone-autoinducer: (TIGR04223 or AgrB)

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.

gnlProkkaIEKEONOM_44 - Region 1 - T3PKS

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 79,775 - 120,944 nt. (total: 41,170 nt) Show pHMM detection rules used

T3PKS: (Chal_sti_synt_C or Chal_sti_synt_N)

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.

gnlProkkaIEKEONOM_75 - Region 1 - terpene

Download region GenBank file

Download region SVG

Location: 1 - 19,453 nt. (total: 19,453 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

terpene: (Terpene_synth or Terpene_synth_C or phytoene_synt or Lycopene_cycl or terpene_cyclase or NapT7 or fung_ggpps or fung_ggpps2 or trichodiene_synth or TRI5)

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

other genes

resistance

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

Gene overview

KnownClusterBlast

Gene/CDS overview

Filter:

Automatically zoom to filtered/selected features

Identifier	Product	Length		Function	Sequence		NCBI Blast	Filter details
		NT	AA		NT	AA

Similar known gene clusters from MIBiG 3.1

No matches found.