Potential risk score of uploaded strain

ARGs VFs PGs PRS
0022.00

PRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
IEKEONOM_776949170195WalR1.62e-114transcriptional regulatory protein84.25100.00EPH95667
IEKEONOM_138576485570CspR5.33e-30cold shock protein84.6198.48AAO82613
IEKEONOM_138576485567CspA8.17e-30cold shock protein84.85100.00CAA62903

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
IEKEONOM_6622053107rep38903 / 90399.00CP005943
IEKEONOM_3883719306rep28936 / 93698.40CP005948
IEKEONOM_602773928839repUS731101 / 110195.46CP002654

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
IEKEONOM_11.00.01.0
IEKEONOM_21.00.01.0
IEKEONOM_30.01.00.0
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IEKEONOM_90.01.00.0
IEKEONOM_100.01.00.0
IEKEONOM_111.00.01.0
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IEKEONOM_801.00.01.0
IEKEONOM_820.01.00.0
IEKEONOM_831.00.01.0
IEKEONOM_840.01.00.0
IEKEONOM_851.00.01.0
IEKEONOM_861.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
IEKEONOM_43662117356FalseSiphoviridaeVOG4632, VOG4632, VOG4609, VOG6414, VOG0205, VOG4841, VOG4581, VOG4544, VOG2935, VOG4556, VOG4568, VOG0204
IEKEONOM_44113436137807FalseSiphoviridaeVOG9998, VOG8870, VOG10957, VOG4599, VOG4605, VOG6163, VOG0660, VOG0209, VOG4586, VOG0207, VOG8239, VOG0205, VOG0204, VOG4553, VOG4573, VOG4556, VOG0202, VOG1886, VOG4581, VOG4841

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)

Insertion sequence (IS) elements